(一)專用紙張:日元 紙張呈淡黃色，含有日本特有植物三椏皮纖維，紙張有非常高的韌性和挺度。
(二)水印:日元的水印圖案與正面主景圖案相同，由于采用了特殊工藝，故水印的清晰度非常高。
(三)雕刻凹版印刷:日元正背主景、行名、面額數字 等均是采用雕刻凹版印刷的，圖案線條精細、層次豐富，用手觸摸有明顯的凹凸感。
(四)凹印縮微文字:日元正背面多處印有“NIPPONGIN KO”字樣的縮微文字。
(五)盲文標記:日元的盲文標記由圓圈組成，用手觸摸有明顯的凸起，透光觀察也是清晰可見。
(六)磁性油墨:日元正背面凹印部位的油墨是帶有磁性的，可用磁性檢測儀測出磁信號。
(七)防復印油墨:日元采用了防復印油墨印刷圖案，當用彩色復印機復印時，復印出來的顏色與原券顏色明顯不同。
(八)光變面額數字:2000日元正面右上角的面額數字是用光變油墨印刷的，與票面呈垂直角度觀察呈藍色，傾斜一定角度則變為紫色。
(九)隱形面額數字:2000日元正面左下角有一裝飾圖案，將票面置于與視線接近平行的位置，面對光源，作45度或90度的旋轉，可看到面額數字“2000”字樣。
(十)珠光油墨:2000日元正面左右兩側邊分別采用珠光油墨各印刷了一條條帶，轉換鈔票角度可看到有顏色變化。
(十一)隱形字母:2000日元背面右上角的綠色底紋處印有隱形字母，垂直角度下無法看到，將票面傾斜一定角度即可看到“NIPPON”字樣，且前3個字母呈藍綠色，后3個字母呈黃色。